Im Jahr 1990 gelang dem Volk ein entscheidender Schlag gegen die Autokratie. Das Mehrparteiensystem wurde wieder eingeführt und demokratische Prinzipien gewannen wieder Anwendung. Die neuen Personen an der Spitze trieben die Demokratisierung jedoch nur halbherzig voran. Menschenrechte wurden unzureichend durchgesetzt und Nepal litt weiterhin unter massiver Korruption. Die Bevölkerung war verarmt und junge Menschen hatten wenig berufliche Perspektiven. Die Maoisten wussten diese Missstände für eigene Interessen zu nutzen. 1995 forderten sie die Umsetzung eines 40-Punkte-Planes, der unter anderem die Abschaffung der Monarchie und die Errichtung einer Volksrepublik vorsah. Bei Nichterfüllung drohte sie mit Guerillaaktionen und bewaffneten Aufstand.

Februar 1996 begann der Aufstand der CPN-Maoist (Communist Party of Nepal - Maoist). Zunächst wollte die Regierung den Konflikt polizeilich zu lösen. Bis 1998 blieb es bei Scharmützeln, ab 1999 eskalierten die Auseinandersetzungen, so dass von Krieg gesprochen werden kann. Bis 2001 kontrollierten die Rebllen fast das ganz Staatsterritorium. Im Juni desselben Jahres kam es zum Blutbad im Königshaus: der Kronprinz Dipendra tötete nach offiziellen Angaben den König und die Königen und acht weitere Familienangehörige. Nach kurzen sehr harten Auseinandersetzungen wurde im Juli ein Waffenstillstand vereinbart, der im November von den Maoisten gebrochen wurde. Das Folgejahr war durch harte Auseinandersetzungen gekennzeichnet. Die komplette Regierungsarmee wurde mobilisiert. Im Jahr 2003 gab es zwischendurch mehrere Waffenruhen, aber die Verhandlungen scheiterten. Die Kontrollen der Sicherheitskräfte blieben streng und immer wieder kam es zu Anschlägen.

Der König hatte 2002 das Parlament aufgelöst und seitdem keine Neuwahlen zugelassen. Stattdessen hat er eigene Spitzenpersonen in die Ämter gesetzt. Die Rebellen fordern nicht mehr die Abschaffung der Monarchie, möchten allerdings eine neue Verfassung durchsetzen. Der Krieg hat bisher ca. 10.000 Todesopfer gefordert. Die Maoisten haben im Jahr 2003 1.200 Personen, insbesondere junge Leute entführt. Bei einer Aktion im März 2004 waren es allein 2.000 Personen, von denen noch 368 als "vermisst" gelten. Nepal bedarf internationaler Vermittlung.