Im Oktober 1944 zogen sich die deutschen Truppen aus Griechenland zurück. Der neue Ministerpräsident Georgios Papandreou verlangte die Auflösung und Entwaffnung der ELAS (Ethnikon Laikos Apeleftherotikos Stratos, Nationale Volksbefreiungsarmee), dem militärischen Flügel der EAM (Ethnikon Apeleftherotikon Metopon, Nationale Befreiungsfront). Nachdem die Führer der ELAS sich der Anordnung widersetzten, verstärkten die Briten ihre Truppen in Athen. Im Dezember 1944 brach der Bürgerkrieg zwischen der ELAS und den Regierungstruppen aus, nachdem bei einer Demonstration die Athener Polizei das Feuer auf die Demonstranten eröffnet hatte. Die ELAS kontrollierte bis auf den britischen Sektor in Athen ganz Griechenland. Die britischen Besatzer unterstützten die Truppen der Regierung. Erzbischof Damaskinos wurde bis zu einer Volksabstimmung über die Wiedereinführung der Monarchie als Regent eingesetzt. Im Februar 1945 gab es einen Waffenstillstand. Die EAM löste die ELAS auf und durfte sich im Gegenzug frei politisch engagieren.

Im Oktober 1945 wurde Griechenland Mitglied der UN. Die ersten Wahlen nach dem Krieg fanden im März 1946 statt. Die königstreue Volkspartei errang einen klaren Sieg. Dieser wurde jedoch unter dem Vorwurf der Manipulation von der EAM angefochten. Georg II. kehrte auf den Thron zurück, starb allerdings kurze Zeit später.

Die griechische Regierung vermutete, dass kommunistische Guerillakämpfer im Norden des Landes Unterstützung von Albanien, Bulgarien und Jugoslawien erhielten. Die unterschiedlichen Gebietsansprüche an den Landesgrenzen verschärften den Konflikt zusätzlich. Der amerikanische Präsident Harry S. Truman unterstützte die Regierungstruppen (Truman-Doktrin). Trotzdem konnten die Rebellen ihre Stellungen weiter halten. Am 16. Oktober 1949 stellten die Rebellen ihre Aktionen gegen die Regierung ein, um die Zerstörung Griechenlands zu verhindern.